MISIÓN DEL ONTOT. Entidad encargada de implementar las Políticas Nacionales de Trasplante, el control de los procedimientos para trasplantes de órganos y tejidos y el cumplimiento de las normas bioéticas de los mismos.

VISIÓN DEL ONTOT. Integrar y establecer el Sistema Nacional de Trasplantes con la participación de las instituciones que forman el sector salud y la sociedad ecuatoriana, dentro de un marco jurídico eficiente y claro, con apego a los principios de equidad, altruismo y justicia.

OBJETIVO GENERAL. Organizar y establecer un sistema técnico administrativo para coordinar las acciones de donación y trasplante en las unidades médicas, tanto públicas, semipúblicas y  privadas, acreditadas a nivel nacional.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS. Mantener una lista nacional de espera de pacientes, para cada tipo de órgano y tejido. Incentivar a los  coordinadores institucionales para mejorar la tasa de donación y procuramiento de órganos que garantice la cobertura de las necesidades de los pacientes receptores. Establecer las Normas y Procedimientos para coordinar y controlar el desarrollo de todas las funciones y aspectos, tanto técnicos como administrativos y económicos (en base a convenios o contratos de prestación de servicios), relacionados con las actividades de donación y trasplante que se hallan contempladas en los documentos legales, colaborando en la consecución de los objetivos nacionales establecidos. Mantener una lista actualizada de las unidades médicas acreditadas para trasplantes con la definición del tipo de trasplantes autorizados, así como la Lista de Espera de pacientes en cada una de ellas.

• Normar y Controlar el seguimiento de los pacientes trasplantados.
• Receptar las estadísticas y necesidades de trasplantes, de los distintos Servicios Hospitalarios, mediante el seguimiento de las listas de espera.
• Colaborar, en casos necesarios, en la logística del transporte de órganos y enfermos para trasplante en las unidades acreditadas dentro del territorio nacional.
• Conocer los índices de capacidad generadora de los hospitales, las tasas de efectividad en: detección de donantes, entrevistas familiares, mantenimiento del donante y la extracción multiorgánica.
• Colaborar y apoyar a las Asociaciones de Enfermos con patologías susceptibles de tratamiento mediante trasplante.
• Mantener el registro físico y computarizado del proceso de trasplantes en el país.
• Establecer y mantener relaciones con otras organizaciones similares en el exterior.